Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB2Q9UPW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB2Q9UPW6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SATB2Q9UPW6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SATB2Q9UPW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SATB2Q9UPW6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms