Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC12A4Q9UP95 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC12A4Q9UP95 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC12A4Q9UP95 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC12A4Q9UP95 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms