Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 SNORD3A-203ENST00000625876 217 nt11.87□□□□□ -0.511e-323■■■■■ 47.8
WDR3Q9UNX4 SNORD3A-202ENST00000620232 218 nt11.7□□□□□ -0.541e-323■■■■■ 47.8
WDR3Q9UNX4 SNORD3A-201ENST00000584923 699 ntBASIC11□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 47.8
WDR3Q9UNX4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 47.5
WDR3Q9UNX4 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.062e-8■■■■■ 45.5
WDR3Q9UNX4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 43.9
WDR3Q9UNX4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.142e-9■■■■■ 43.5
WDR3Q9UNX4 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 218.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 42.2
WDR3Q9UNX4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 42.2
WDR3Q9UNX4 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 42.2
WDR3Q9UNX4 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 42.2
WDR3Q9UNX4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.833e-7■■■■■ 41.6
WDR3Q9UNX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.563e-7■■■■■ 41.6
WDR3Q9UNX4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 41.6
WDR3Q9UNX4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 41.6
WDR3Q9UNX4 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 41.5
WDR3Q9UNX4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 38.5
WDR3Q9UNX4 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 38.5
WDR3Q9UNX4 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 36.7
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.89■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.815e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.25e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.545e-9■■■■■ 35.9
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 524.07■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 520.75■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 517.09■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 316.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 516.74■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 215.87■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-202ENST00000517546 864 ntTSL 215.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR210HG-204ENST00000534540 367 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-202ENST00000561488 638 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-224ENST00000601119 750 ntTSL 514.15□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 513.78□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 513.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-205ENST00000564337 605 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-216ENST00000523772 777 ntTSL 511.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-206ENST00000520670 623 ntTSL 511.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-209ENST00000521008 572 ntTSL 311.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 INTS10-207ENST00000520827 631 ntTSL 38.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 XPO6-210ENST00000566175 248 ntTSL 36.65□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 35.6
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 525.48■■□□□ 1.677e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 222.65■■□□□ 1.227e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.027e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 219.65■□□□□ 0.747e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.577e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 218.12■□□□□ 0.497e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 416.57■□□□□ 0.247e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 515.2■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 33.5
WDR3Q9UNX4 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 526.39■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 420.55■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 319.88■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 316.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 313.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 32.1
WDR3Q9UNX4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.319e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 524.98■■□□□ 1.599e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.529e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 524.32■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.489e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.399e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.349e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.319e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 323.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 323.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 523.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.269e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.199e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.189e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 522.22■■□□□ 1.159e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 PHKG2-209ENST00000565924 908 ntTSL 322.18■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 31.6
WDR3Q9UNX4 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 221.28■■□□□ 19e-7■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 127.5 ms