Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPT2Q9UMR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPT2Q9UMR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPT2Q9UMR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPT2Q9UMR5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms