Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ABT1Q9ULW3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ABT1Q9ULW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ABT1Q9ULW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ABT1Q9ULW3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABT1Q9ULW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABT1Q9ULW3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABT1Q9ULW3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABT1Q9ULW3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABT1Q9ULW3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ABT1Q9ULW3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ABT1Q9ULW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms