Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZMYND8Q9ULU4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZMYND8Q9ULU4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZMYND8Q9ULU4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZMYND8Q9ULU4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZMYND8Q9ULU4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZMYND8Q9ULU4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms