Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF490Q9ULM2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF490Q9ULM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF490Q9ULM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF490Q9ULM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms