Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB23Q9ULC3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB23Q9ULC3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB23Q9ULC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB23Q9ULC3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB23Q9ULC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB23Q9ULC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB23Q9ULC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms