Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2LQ9UL33 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2LQ9UL33 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAPPC2LQ9UL33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms