Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO4Q9UKT5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO4Q9UKT5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FBXO4Q9UKT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXO4Q9UKT5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXO4Q9UKT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXO4Q9UKT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXO4Q9UKT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms