Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PARP4Q9UKK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PARP4Q9UKK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PARP4Q9UKK3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PARP4Q9UKK3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PARP4Q9UKK3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PARP4Q9UKK3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PARP4Q9UKK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PARP4Q9UKK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PARP4Q9UKK3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PARP4Q9UKK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PARP4Q9UKK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms