Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF223Q9UK11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF223Q9UK11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF223Q9UK11 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF223Q9UK11 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF223Q9UK11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF223Q9UK11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms