Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CTNNA3Q9UI47 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CTNNA3Q9UI47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CTNNA3Q9UI47 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CTNNA3Q9UI47 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CTNNA3Q9UI47 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CTNNA3Q9UI47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms