Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN2Q9UHV9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PFDN2Q9UHV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PFDN2Q9UHV9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PFDN2Q9UHV9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PFDN2Q9UHV9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN2Q9UHV9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PFDN2Q9UHV9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms