Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD4

CIDEB, Cell death activator CIDE-B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEBQ9UHD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIDEBQ9UHD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CIDEBQ9UHD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CIDEBQ9UHD4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CIDEBQ9UHD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CIDEBQ9UHD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms