Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHORDC1Q9UHD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHORDC1Q9UHD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHORDC1Q9UHD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHORDC1Q9UHD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms