Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SS18L2Q9UHA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SS18L2Q9UHA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18L2Q9UHA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18L2Q9UHA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms