Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGXB4Q9UGU5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGXB4Q9UGU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMGXB4Q9UGU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGXB4Q9UGU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGXB4Q9UGU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HMGXB4Q9UGU5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGXB4Q9UGU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms