Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA9Q9UGM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA9Q9UGM1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA9Q9UGM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRNA9Q9UGM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNA9Q9UGM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms