Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EXTL2Q9UBQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXTL2Q9UBQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL2Q9UBQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL2Q9UBQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms