Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEMTQ9UBM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PEMTQ9UBM1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEMTQ9UBM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PEMTQ9UBM1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PEMTQ9UBM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEMTQ9UBM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms