Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
XCL2Q9UBD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XCL2Q9UBD3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
XCL2Q9UBD3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
XCL2Q9UBD3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms