Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Slit2Q9R1B9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Slit2Q9R1B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slit2Q9R1B9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Slit2Q9R1B9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slit2Q9R1B9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Slit2Q9R1B9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slit2Q9R1B9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slit2Q9R1B9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slit2Q9R1B9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Slit2Q9R1B9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Slit2Q9R1B9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Slit2Q9R1B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slit2Q9R1B9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 468.9 ms