Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr54Q9R0D8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Wdr54Q9R0D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr54Q9R0D8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Wdr54Q9R0D8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Wdr54Q9R0D8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Wdr54Q9R0D8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms