Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf4Q9QZS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf4Q9QZS2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf4Q9QZS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf4Q9QZS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf4Q9QZS2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf4Q9QZS2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms