Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a3Q9QZS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a3Q9QZS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a3Q9QZS0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a3Q9QZS0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col4a3Q9QZS0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a3Q9QZS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a3Q9QZS0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a3Q9QZS0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms