Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpc3Q9QZC1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpc3Q9QZC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc3Q9QZC1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpc3Q9QZC1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpc3Q9QZC1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpc3Q9QZC1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpc3Q9QZC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.6 ms