Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CenphQ9QYM8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CenphQ9QYM8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CenphQ9QYM8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenphQ9QYM8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenphQ9QYM8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms