Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VapbQ9QY76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VapbQ9QY76 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VapbQ9QY76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VapbQ9QY76 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VapbQ9QY76 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms