Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irx4Q9QY61 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irx4Q9QY61 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Irx4Q9QY61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Irx4Q9QY61 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Irx4Q9QY61 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Irx4Q9QY61 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms