Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snai3Q9QY31 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snai3Q9QY31 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snai3Q9QY31 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai3Q9QY31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snai3Q9QY31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms