Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Apbb1Q9QXJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Apbb1Q9QXJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Apbb1Q9QXJ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Apbb1Q9QXJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Apbb1Q9QXJ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Apbb1Q9QXJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Apbb1Q9QXJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Apbb1Q9QXJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Apbb1Q9QXJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Apbb1Q9QXJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apbb1Q9QXJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Apbb1Q9QXJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms