Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trp53inp1Q9QXE4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trp53inp1Q9QXE4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trp53inp1Q9QXE4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms