Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PdcQ9QW08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PdcQ9QW08 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PdcQ9QW08 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PdcQ9QW08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PdcQ9QW08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PdcQ9QW08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms