Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MARCH4Q9P2E8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH4Q9P2E8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
MARCH4Q9P2E8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH4Q9P2E8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH4Q9P2E8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH4Q9P2E8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms