Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B7

CFAP97, Cilia- and flagella-associated protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP97Q9P2B7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP97Q9P2B7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP97Q9P2B7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP97Q9P2B7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP97Q9P2B7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP97Q9P2B7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP97Q9P2B7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP97Q9P2B7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms