Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VAPAQ9P0L0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VAPAQ9P0L0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VAPAQ9P0L0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VAPAQ9P0L0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms