Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LMCD1Q9NZU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMCD1Q9NZU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMCD1Q9NZU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMCD1Q9NZU5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMCD1Q9NZU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMCD1Q9NZU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMCD1Q9NZU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMCD1Q9NZU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms