Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A2-207ENST00000480768 1278 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-20■■■■■ 36.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 224.75■■□□□ 1.555e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-209ENST00000475010 3467 ntTSL 214.04□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 36.4
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.65■□□□□ 0.96e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.25■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.196e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.656e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-213ENST00000550968 2313 ntTSL 210.81□□□□□ -0.686e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -16e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.16e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-207ENST00000462618 428 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.156e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.166e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CDK6-203ENST00000467166 779 ntTSL 27.19□□□□□ -1.269e-21■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-205ENST00000529197 1149 ntTSL 1 (best)6.55□□□□□ -1.366e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.396e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.426e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-203ENST00000412148 2880 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.56e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM126B-203ENST00000526822 853 ntTSL 25.56□□□□□ -1.526e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCDC88A-208ENST00000444458 4236 ntTSL 22.5□□□□□ -2.016e-11■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 37.87□□□□□ -1.153e-9■■■■■ 36.3
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.253e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 24.75□□□□□ -1.653e-11■■■■■ 36.2
IGF2BP1Q9NZI8 MDC1-207ENST00000492462 819 ntTSL 311.59□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 MSL2-205ENST00000491050 559 ntTSL 47.04□□□□□ -1.281e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFB5-213ENST00000493716 476 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 MSL2-204ENST00000481989 576 ntTSL 44.03□□□□□ -1.761e-11■■■■■ 36.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2A-213ENST00000482471 287 ntTSL 55.97□□□□□ -1.457e-10■■■■■ 35.9
IGF2BP1Q9NZI8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 35.8
IGF2BP1Q9NZI8 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.82□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 35.8
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-221ENST00000588721 647 ntTSL 216.7■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-218ENST00000588488 705 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-215ENST00000587491 2934 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-212ENST00000585618 2712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 SEC14L1-227ENST00000591437 2828 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-9■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 PCYOX1-204ENST00000433351 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 35.7
IGF2BP1Q9NZI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 516■□□□□ 0.154e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 315.75■□□□□ 0.114e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-203ENST00000538686 2077 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-211ENST00000559257 2217 ntTSL 59.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)7.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.117e-7■■■■■ 35.6
IGF2BP1Q9NZI8 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 NFAT5-211ENST00000568832 850 ntTSL 27.74□□□□□ -1.172e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-216ENST00000487714 689 ntTSL 25.64□□□□□ -1.514e-22■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CD52-202ENST00000470468 381 ntTSL 34.15□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-204ENST00000526676 467 ntTSL 415.12■□□□□ 0.011e-20■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-203ENST00000477012 1036 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 CCNH-207ENST00000510020 582 ntTSL 34.36□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.058e-9■■■■■ 35.5
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-201ENST00000355237 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 OCLN-204ENST00000514370 958 ntTSL 1 (best)6.54□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2A-206ENST00000465535 1273 ntTSL 57.61□□□□□ -1.193e-9■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 35.4
IGF2BP1Q9NZI8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-10■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-202ENST00000527465 595 ntTSL 410.17□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 35.3
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 519.07■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 318.11■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.284e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 27.02□□□□□ -1.294e-9■■■■■ 35.2
IGF2BP1Q9NZI8 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-9■■■■■ 35.2
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