Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GGA3Q9NZ52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GGA3Q9NZ52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GGA3Q9NZ52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GGA3Q9NZ52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GGA3Q9NZ52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA3Q9NZ52 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms