Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNK4Q9NYG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNK4Q9NYG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNK4Q9NYG8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNK4Q9NYG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms