Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY97

B3GNT2, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT2Q9NY97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
B3GNT2Q9NY97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT2Q9NY97 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B3GNT2Q9NY97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3GNT2Q9NY97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT2Q9NY97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms