Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C2orf42Q9NWW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
C2orf42Q9NWW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2orf42Q9NWW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C2orf42Q9NWW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C2orf42Q9NWW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C2orf42Q9NWW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms