Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK1IP1Q9NWT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAK1IP1Q9NWT1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAK1IP1Q9NWT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK1IP1Q9NWT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms