Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
IFT57Q9NWB7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.79■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
IFT57Q9NWB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
IFT57Q9NWB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
IFT57Q9NWB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
IFT57Q9NWB7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
IFT57Q9NWB7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IFT57Q9NWB7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms