Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1BQ9NVP2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1BQ9NVP2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASF1BQ9NVP2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASF1BQ9NVP2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms