Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SETD4Q9NVD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SETD4Q9NVD3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD4Q9NVD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD4Q9NVD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SETD4Q9NVD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SETD4Q9NVD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms