Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF19AQ9NV58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF19AQ9NV58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF19AQ9NV58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF19AQ9NV58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF19AQ9NV58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF19AQ9NV58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms