Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCF3Q9NUQ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCF3Q9NUQ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCF3Q9NUQ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ABCF3Q9NUQ8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCF3Q9NUQ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCF3Q9NUQ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms