Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C19orf12Q9NSK7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C19orf12Q9NSK7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C19orf12Q9NSK7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C19orf12Q9NSK7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms